1、挂藏。晾晒过的洋葱经挑选后，将发黄、绵软的叶子编成长约1米的“辫子”，每辫40～60头，两条单辫结在一起为一挂，再晾晒5～6天，至叶片全黄，洋葱头充分干燥即可贮藏。选阴凉、干燥、通风的房屋或荫棚下，将洋葱辫挂在木架上，不接触地面，并要防淋雨或水浸，贮藏期不倒动。此法通风好，腐烂少，但抑芽效果较差，贮期短，一般只能贮到国庆节。
2、垛藏。此法贮藏期长，效果好。要求选择地势高、土质干燥、排水好的场地，先在地面垫枕木，上铺秸秆，再放洋葱辫，纵横交错摆齐，码成长5～6米，宽1.5～2米，高1.5米的小方垛，每垛5吨左右，垛顶盖3～4层席子或加1层油毡，四周加2层席子，用绳子横竖绑紧，用泥封严贮藏垛，防止日晒雨淋，保持干燥。封后一般不倒垛，可贮3个月以上。每逢雨后要仔细检查，如有漏雨应开垛晾晒。贮至10月要加盖草帘保温，寒冷地区应转入库内贮藏以防受冻。洋葱受冻后,只要心部未冻透，解冻后仍可恢复原状。
3、冷库贮藏。冷库贮藏是当前洋葱贮藏较好的方法。须在8月中下旬洋葱脱离休眠前入库。码垛或装筐码垛，架藏或入塑料袋架藏，温度维持在0℃，可长期贮藏。缺点是冷藏一般湿度较高，鳞茎常会长出不定根。